Lisans iptalleri Kurumca yapılacak soruşturma neticesine göre karara bağlanacak. Ancak  213 sayılı Vergi Usul Kanununda yer alan vergi kaçakçılığı suçları dahil kaçakçılık fiillerine ilişkin olarak mahkemelerden kesinleşmiş mahkumiyet kararı gelmesi halinde, mevcut lisansın iptaline ilişkin işlemler bu Yönetmelik hükümlerine tabi olmaksızın lisans işlemlerini yürüten ilgili Daire Başkanlığı tarafından yerine getirilecek.

Öte yandan gerçek faydalanıcının belirlenmesine ve bildirilmesine ilişkin Vergi Usul Kanunu Genel Tebliği (Sıra No: 529) 'da yapılan değişiklikle Tebliğin dayandırıldığı Kanun hükümlerinde değişiklik yapıldı. Buna göre tebliğin dayandığı kanun  hükümlerinden olan mükerrer 257 nci maddesinin birinci fıkrasının (4) numaralı bendi ifadesi mükerrer 257 nci maddesinin birinci fıkrasının (9) numaralı bendi olarak değiştirildi.