Gümrük Yönetmeliğinin taşıtların kontrolüne ilişkin hükümlerinde, fikri ve sınai hakların korunmasına ilişkine hükümlerinde, gümrük beyan ve rejimlerine ilişkin hükümlerinde , beyanname yerine kullanılan belgelere ilişkin hükümlerinde, muayenelere  ilişkin hükümlerinde, laboratuvar tahliline tabi tutulacak eşyaya ilişkin hükümlerinde, transit rejime ilişkin hükümlerinde ve diğer bazı bölümlerinde düzenlemeler yapıldı.

Yönetmeliğin taşıtların kontrolüne ilişkin hükümlerde şu değişiklik yapıldı:

Sahip ve acentelerince gümrük idaresine önceden bildirim yapmak suretiyle yük almaya giderken seferleri esnasında yükleri iptal edilen veya yük boşaltmaya giderken seferleri esnasında yük boşaltma limanları değişen ve geriye dönüş yapmayan gemilerin bu durumları rota değişikliği sayılmayacak.

Fikri ve sınai hakların korunmasına ilişkin değişikliğe göre ise Gümrük idaresince re’sen alıkonulan veya gümrük işlemleri durdurulan eşya için, başvuruda bulunmak üzere hak sahibine; ayrıca beyan sahibi veya eşyayı elinde bulundurana alıkoyma veya durdurma işlemini takip eden ilk iş günü içerisinde bildirimde bulunulacak; Fikri ve sınai hakları ihlal eder nitelikteki eşyanın alıkonulması veya gümrük işlemlerinin durdurulması talebini yapacakların söz konusu eşya ile ilgili olarak hak sahibi olduklarını ve hakkın Türkiye’de tescil edildiğini kanıtlayan bir belgeyi de eklemeleri gerekecek.