Bilindiği üzere 1999 yılından beri yatırımların kazanç vergileri yoluyla teşvikinde yeni bir sistem uygulanmaktadır. Yeni sistem her bir yatırım için yatırıma katkı tutarı belirlenmesi ve bu tutara ulaşılıncaya kadar yatırımdan elde edilen kazancın indirimli oranla vergilendirilmesi esasına dayanmaktadır.

İndirimli vergi uygulamasına ilişkin esas düzenleme KVK’nın 32/A maddesinde yapılmış olup, uygulamaya ilişkin esaslar Bakanlar Kurulunca çıkarılan Yatırımlara Sağlanan Devlet Teşviklerine İlişkin Kararlar ile belirlenmektedir. Maliye Bakanlığı bugüne kadar konuyla ilgili olarak Genel Tebliğ veya Sirküler bazında herhangi bir açıklama yapmamış, özelge bazında verdiği görüşlerle konuyu yönlendirmiştir.

Yatırımlara sağlanan teşviklerle ilgili olarak halen 2012/3305 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı yürürlükte olup, anılan Kararda indirimli vergi uygulamasına yönelik olarak da bazı değişiklikler yapılmıştır..

2012/3305 sayılı Kararda teşvik unsurlarından yararlanma bakımından yatırımlar;

- Genel teşvik uygulamalarından yararlanacak yatırımlar,

- Bölgesel teşvik uygulamalarından yararlanacak yatırımlar,

- Büyük ölçekli yatırımlar,

- Stratejik yatırımlar,

- AR-GE ve çevre yatırımları,

olarak sınıflandırılmış, her yatırım sınıfı itibarıyla uygulanacak destek unsurları da farklılaştırılmıştır. İndirimli vergi uygulaması; bölgesel teşvik uygulamalarından yararlanacak yatırımlar, büyük ölçekli yatırımlar ve stratejik yatırımlar için öngörülmüş bir teşvik unsurudur.

İndirimli vergi oranı yatırımlardan elde edilen kazançlara uygulandığından, yatırımın tamamlanıp kısmen veya tamamen işletilmeye ve yatırımdan kazanç elde edilmeye başlanması gerekmektedir. KVK’nın 32/A maddesinin 1. fıkrasında indirimli oran uygulamasının yatırımın kısmen veya tamamen işletilmesine başlanılan hesap döneminde başlayacağı, 4. fıkrasında ise indirimli oran uygulamasına yatırımın kısmen veya tamamen faaliyete geçtiği geçici vergi döneminde başlanacağı hükmü bulunmaktadır.

Bununla birlikte, 6322 sayılı Kanunla KVK’nın 32/A maddesinde yapılan değişiklikle yatırımın tamamlanması beklenmeden, yatırım aşamasında da yatırımcının diğer faaliyetlerinden elde ettiği kazançlara indirimli vergi oranı uygulanmasına imkan tanınmıştır.

Yatırım aşamasında diğer kazançlar nedeniyle indirimli vergi uygulaması 2013 yılı başından itibaren yürürlüğe girmiş olup, 01.01.2012 tarihinden itibaren alınan teşvik belgeleri kapsamında yapılan yatırımlar için söz konusudur.